Bioteknologi merupakan perpaduan dari beberapa cabang ilmu yang mempelajari pemanfaatan makhluk hidup (bakteri, hewan, tumbuhan) dan materi biologis (virus, prion) maupun produk dari makhluk hidup (protein, enzim, senyawa aktif) dalam proses produksi untuk menghasilkan barang dan jasa. Saat ini, perkembangan bioteknologi tidak hanya didasarkan pada biologi semata, tetapi juga pada ilmu-ilmu terapan dan ilmu murni lainnya, seperti biokimia, komputer, biologi molekular, mikrobiologi, genetika, kimia, matematika, dan sebagainya. Pengembangan kajian bioteknologi yang diterapkan pada Program Studi Bioteknologi Universitas ‘Aisyiyah Yogyakarta meliputi 2 bidang konsentrasi yaitu Bioteknologi Kesehatan dan Bioteknologi Pertanian. Program Studi Bioteknologi ini didirikan berdasarkan Keputusan Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia Nomor 109/KPT/I/2016 dan resmi berdiri pada tanggal 10 Maret 2016.